Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp25P57080 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp25P57080 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp25P57080 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp25P57080 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp25P57080 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp25P57080 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp25P57080 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp25P57080 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp25P57080 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp25P57080 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp25P57080 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms