Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rrp1P56183 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp1P56183 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms