Protein–RNA interactions for Protein: P51943

Ccna2, Cyclin-A2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna2P51943 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccna2P51943 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccna2P51943 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccna2P51943 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccna2P51943 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccna2P51943 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccna2P51943 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccna2P51943 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccna2P51943 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccna2P51943 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccna2P51943 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccna2P51943 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccna2P51943 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccna2P51943 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccna2P51943 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccna2P51943 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccna2P51943 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccna2P51943 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccna2P51943 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccna2P51943 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccna2P51943 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccna2P51943 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccna2P51943 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccna2P51943 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccna2P51943 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccna2P51943 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccna2P51943 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccna2P51943 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccna2P51943 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccna2P51943 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccna2P51943 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccna2P51943 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccna2P51943 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccna2P51943 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccna2P51943 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccna2P51943 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccna2P51943 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccna2P51943 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccna2P51943 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccna2P51943 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccna2P51943 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccna2P51943 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccna2P51943 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccna2P51943 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccna2P51943 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccna2P51943 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccna2P51943 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccna2P51943 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccna2P51943 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccna2P51943 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccna2P51943 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccna2P51943 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccna2P51943 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccna2P51943 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccna2P51943 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccna2P51943 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccna2P51943 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccna2P51943 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccna2P51943 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccna2P51943 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccna2P51943 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccna2P51943 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms