Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa11P50709 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa11P50709 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa11P50709 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa11P50709 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa11P50709 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa11P50709 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa11P50709 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms