Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen1P49769 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen1P49769 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen1P49769 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen1P49769 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen1P49769 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen1P49769 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psen1P49769 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psen1P49769 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psen1P49769 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psen1P49769 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.7 ms