Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atoh1P48985 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atoh1P48985 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atoh1P48985 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms