Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TgfaP48030 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TgfaP48030 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TgfaP48030 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TgfaP48030 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TgfaP48030 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TgfaP48030 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TgfaP48030 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TgfaP48030 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfaP48030 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfaP48030 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfaP48030 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfaP48030 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfaP48030 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TgfaP48030 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TgfaP48030 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TgfaP48030 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TgfaP48030 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfaP48030 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfaP48030 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfaP48030 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TgfaP48030 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms