Protein–RNA interactions for Protein: P46718

Pdcd2, Programmed cell death protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd2P46718 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdcd2P46718 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms