Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx2-5P42582 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-5P42582 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125 ms