Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nkx1-2P42580 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx1-2P42580 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms