Protein–RNA interactions for Protein: P35486

Pdha1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdha1P35486 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdha1P35486 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdha1P35486 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdha1P35486 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdha1P35486 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdha1P35486 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdha1P35486 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdha1P35486 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdha1P35486 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdha1P35486 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdha1P35486 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdha1P35486 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdha1P35486 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms