Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PpardP35396 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PpardP35396 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PpardP35396 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PpardP35396 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PpardP35396 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PpardP35396 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PpardP35396 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PpardP35396 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PpardP35396 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PpardP35396 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PpardP35396 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PpardP35396 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PpardP35396 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PpardP35396 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PpardP35396 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PpardP35396 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PpardP35396 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PpardP35396 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PpardP35396 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpardP35396 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpardP35396 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpardP35396 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpardP35396 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpardP35396 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpardP35396 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpardP35396 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpardP35396 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpardP35396 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpardP35396 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PpardP35396 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PpardP35396 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PpardP35396 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PpardP35396 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PpardP35396 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PpardP35396 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PpardP35396 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PpardP35396 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PpardP35396 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PpardP35396 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PpardP35396 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PpardP35396 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PpardP35396 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PpardP35396 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PpardP35396 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PpardP35396 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PpardP35396 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PpardP35396 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PpardP35396 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PpardP35396 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PpardP35396 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PpardP35396 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PpardP35396 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PpardP35396 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PpardP35396 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PpardP35396 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PpardP35396 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PpardP35396 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PpardP35396 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PpardP35396 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PpardP35396 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PpardP35396 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PpardP35396 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PpardP35396 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PpardP35396 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PpardP35396 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PpardP35396 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PpardP35396 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PpardP35396 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PpardP35396 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PpardP35396 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PpardP35396 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PpardP35396 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PpardP35396 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PpardP35396 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PpardP35396 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PpardP35396 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PpardP35396 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PpardP35396 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PpardP35396 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PpardP35396 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PpardP35396 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PpardP35396 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PpardP35396 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PpardP35396 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PpardP35396 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PpardP35396 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PpardP35396 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PpardP35396 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PpardP35396 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PpardP35396 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PpardP35396 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PpardP35396 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PpardP35396 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PpardP35396 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PpardP35396 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PpardP35396 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PpardP35396 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PpardP35396 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PpardP35396 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms