Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rom1P32958 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rom1P32958 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rom1P32958 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rom1P32958 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rom1P32958 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rom1P32958 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rom1P32958 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms