Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxc11P31313 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms