Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kif3aP28741 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kif3aP28741 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms