Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna1P26231 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna1P26231 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms