Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms