Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxd8P23463 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd8P23463 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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