Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ifrd1P19182 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ifrd1P19182 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms