Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18528 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18528 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18528 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18528 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18528 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18528 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P18528 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18528 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P18528 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P18528 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
P18528 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18528 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18528 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18528 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18528 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18528 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18528 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18528 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18528 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18528 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18528 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18528 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18528 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18528 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18528 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18528 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18528 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18528 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P18528 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18528 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18528 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18528 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18528 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18528 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18528 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18528 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P18528 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18528 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18528 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18528 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18528 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18528 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18528 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18528 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18528 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18528 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18528 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18528 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P18528 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18528 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18528 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18528 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18528 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18528 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18528 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18528 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P18528 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18528 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18528 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18528 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18528 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18528 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18528 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18528 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18528 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18528 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18528 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18528 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms