Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb1P17919 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms