Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim30aP15533 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30aP15533 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms