Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb8P09632 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb8P09632 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms