Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxb3P09026 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxb3P09026 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxb3P09026 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxb3P09026 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxb3P09026 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxb3P09026 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxb3P09026 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxb3P09026 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms