Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lamc1P02468 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lamc1P02468 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms