Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sypl2O89104 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sypl2O89104 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sypl2O89104 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sypl2O89104 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sypl2O89104 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sypl2O89104 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sypl2O89104 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sypl2O89104 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sypl2O89104 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.7 ms