Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ShdO88834 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ShdO88834 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ShdO88834 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ShdO88834 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ShdO88834 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ShdO88834 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ShdO88834 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ShdO88834 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ShdO88834 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ShdO88834 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ShdO88834 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ShdO88834 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ShdO88834 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ShdO88834 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ShdO88834 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ShdO88834 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ShdO88834 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ShdO88834 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ShdO88834 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ShdO88834 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ShdO88834 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ShdO88834 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ShdO88834 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ShdO88834 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ShdO88834 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ShdO88834 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ShdO88834 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ShdO88834 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ShdO88834 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ShdO88834 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ShdO88834 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ShdO88834 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ShdO88834 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ShdO88834 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ShdO88834 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ShdO88834 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ShdO88834 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ShdO88834 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ShdO88834 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ShdO88834 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ShdO88834 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ShdO88834 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ShdO88834 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ShdO88834 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ShdO88834 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ShdO88834 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ShdO88834 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ShdO88834 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ShdO88834 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ShdO88834 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ShdO88834 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ShdO88834 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ShdO88834 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ShdO88834 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ShdO88834 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ShdO88834 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ShdO88834 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ShdO88834 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ShdO88834 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ShdO88834 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ShdO88834 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ShdO88834 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ShdO88834 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ShdO88834 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ShdO88834 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ShdO88834 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ShdO88834 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ShdO88834 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ShdO88834 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ShdO88834 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ShdO88834 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ShdO88834 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ShdO88834 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ShdO88834 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ShdO88834 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ShdO88834 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ShdO88834 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ShdO88834 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ShdO88834 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ShdO88834 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ShdO88834 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ShdO88834 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ShdO88834 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ShdO88834 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ShdO88834 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ShdO88834 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ShdO88834 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ShdO88834 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ShdO88834 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ShdO88834 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ShdO88834 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ShdO88834 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ShdO88834 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ShdO88834 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ShdO88834 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ShdO88834 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ShdO88834 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ShdO88834 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ShdO88834 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms