Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfdp1O88271 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Cfdp1O88271 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfdp1O88271 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms