Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cer1O55233 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cer1O55233 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cer1O55233 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cer1O55233 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cer1O55233 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cer1O55233 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cer1O55233 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cer1O55233 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cer1O55233 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cer1O55233 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cer1O55233 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cer1O55233 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cer1O55233 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cer1O55233 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cer1O55233 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cer1O55233 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cer1O55233 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cer1O55233 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cer1O55233 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cer1O55233 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cer1O55233 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms