Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pole2O54956 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pole2O54956 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pole2O54956 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pole2O54956 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pole2O54956 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pole2O54956 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pole2O54956 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pole2O54956 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pole2O54956 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pole2O54956 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pole2O54956 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pole2O54956 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pole2O54956 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pole2O54956 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Pole2O54956 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pole2O54956 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pole2O54956 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pole2O54956 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pole2O54956 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pole2O54956 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pole2O54956 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pole2O54956 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pole2O54956 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms