Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2f6O54917 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f6O54917 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f6O54917 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f6O54917 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2f6O54917 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2f6O54917 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2f6O54917 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f6O54917 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f6O54917 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f6O54917 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f6O54917 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms