Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-ObO35424 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-ObO35424 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms