Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec22bO08547 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec22bO08547 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec22bO08547 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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