Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vwa3bJ9JI28 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vwa3bJ9JI28 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms