Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm8356J3QPD3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8356J3QPD3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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