Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim18J3QNP2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim18J3QNP2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim18J3QNP2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim18J3QNP2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim18J3QNP2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim18J3QNP2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim18J3QNP2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim18J3QNP2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim18J3QNP2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms