Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c3J3QJW5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34c3J3QJW5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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