Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm17535J3KMR8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm17535J3KMR8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17535J3KMR8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17535J3KMR8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17535J3KMR8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17535J3KMR8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17535J3KMR8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17535J3KMR8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17535J3KMR8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17535J3KMR8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17535J3KMR8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17535J3KMR8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm17535J3KMR8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm17535J3KMR8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm17535J3KMR8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm17535J3KMR8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms