Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hmgxb3G3X9M3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hmgxb3G3X9M3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms