Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h12bG3X9I7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h12bG3X9I7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms