Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U3

2210016F16Rik, MCG6895, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210016F16RikG3X8U3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
2210016F16RikG3X8U3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2210016F16RikG3X8U3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2210016F16RikG3X8U3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms