Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn34aG3UW52 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34aG3UW52 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34aG3UW52 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34aG3UW52 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34aG3UW52 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34aG3UW52 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34aG3UW52 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34aG3UW52 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34aG3UW52 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn34aG3UW52 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn34aG3UW52 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn34aG3UW52 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn34aG3UW52 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn34aG3UW52 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn34aG3UW52 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34aG3UW52 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34aG3UW52 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms