Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4aF8VPX6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4aF8VPX6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms