Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h7bF8VPP8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zc3h7bF8VPP8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h7bF8VPP8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms