Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcdh9F8VPK8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdh9F8VPK8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcdh9F8VPK8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms