Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8220F6YKI2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8220F6YKI2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8220F6YKI2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms