Protein–RNA interactions for Protein: F6S0S7

E130114P18Rik, RIKEN cDNA E130114P18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130114P18RikF6S0S7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130114P18RikF6S0S7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E130114P18RikF6S0S7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130114P18RikF6S0S7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms