Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
2610001J05RikF2Z3Y9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
2610001J05RikF2Z3Y9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610001J05RikF2Z3Y9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms