Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DspE9Q557 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DspE9Q557 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DspE9Q557 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DspE9Q557 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DspE9Q557 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DspE9Q557 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DspE9Q557 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DspE9Q557 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms