Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20518E9Q548 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20518E9Q548 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms